吳國發(fā)在計算機軟件、數(shù)學和統(tǒng)計學、自動控制理論與應(yīng)用、材料科學與工程等領(lǐng)域的科學研究和技術(shù)開發(fā)中取得了許多成果。吳國發(fā)在計算機應(yīng)用軟件的各個領(lǐng)域都有很高的水平。吳國發(fā)在應(yīng)用數(shù)學、控制理論和斷裂力學領(lǐng)域提出的數(shù)學方法和理論模型得到了有關(guān)科研人員的應(yīng)用。他在社會科學方面也頗有造詣。吳國發(fā)在二十多個中英文刊物和六個國際學術(shù)會議上發(fā)表過100多篇論文，為美國的公司和政府部門開發(fā)了50多個計算機軟件。他主持研制的新一代IC卡系統(tǒng)于2010年11月獲得了中國的專利。

吳國發(fā)教授是一位熱心為公眾服務(wù)的社會活動家。他與美國和加拿大主流社會的幾個著名華人專家、企業(yè)家共同創(chuàng)辦了北美專家企業(yè)家協(xié)會 。該協(xié)會的名譽會長包括四個諾貝爾獎得主、中國三個領(lǐng)導人（兩個全國人大常委會副委員長和一個全國政協(xié)副主席）、加拿大科學院院長。四十多個世界第一流的科學家、專家、企業(yè)家、經(jīng)濟學家擔任協(xié)會的顧問。他積極組織中國與美國之間的科學技術(shù)和工商業(yè)交流活動。為此，從1999年以來，吳國發(fā)訪問了中國20多個城市，受到了有關(guān)省市領(lǐng)導的熱情歡迎。2002年11月，吳國發(fā)在美國波士頓市主持了經(jīng)濟全球化和中國工商業(yè)報告會（會場分別設(shè)在哈佛大學和麻省理工學院），包括諾貝爾獎得主在內(nèi)的六個世界杰出經(jīng)濟學家、專家、企業(yè)家和科學家在會上作了報告。

吳國發(fā)擔任的重要社會團體職務(wù)如下：北美專家企業(yè)家協(xié)會（總部在美國）會長，國際計算機軟件協(xié)會會長（總部在美國），世界健康產(chǎn)業(yè)協(xié)會（總部在美國）會長，太平洋論壇組織（總部在美國）理事長，世界華僑華人社團聯(lián)合總會副會長（總部在北京），中國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè)理事會副理事長，全國醫(yī)院信息技術(shù)人才培訓組織委員會主任。