1.中醫不科學，必須以西醫的方式看待中醫。
分析：中醫其實就是一門實踐科學。至于規律，將其歸為陰陽五行里邊，經過千百年來證實，這個歸類是合乎事實的。至于有沒有陰陽五行，或者陰陽五行到底是什么，現代科技解釋不了，古人也沒有完全解釋得了，到目前為止只是個抽象概念。西方科學只是個新生事物，一切用那種不成熟的標準去解釋，顯得是多幼稚可笑。
其實，我覺得，方舟子并不是認為中醫不科學， 只是覺得，中華文化沒有必要保留，需要使用以西方為主的科學技術，而這些科學技術，西方有話語權，有專利權。只不過希望把中國事關生命的醫療事業交給西方控制罷了。
2.方舟子支持轉基因。轉基因食品來源于西方的科學研究。并未經過多少年的實驗，也沒有證明對人身體沒有潛在危害或者安全風險。對于這樣一個未定的東西，方舟子并不顧他的所謂“科學”理論，卻強調，用他“科學”檢驗出來的轉基因是無害的。我不得不再次申明，西方的科學才幾百年歷程，而且在科學發展的過程中不斷修正?，F在認識到的科學原理，并不一定就是真理。只有經過實踐檢驗了之后才能成為科學這里。可是就是這個不成熟的產品，方舟子卻極力推薦和煽動。誰敢說轉基因食品不能像當初感冒藥中的PPA一樣，當時認為是安全的，最后發現這種物質那么多的危害？
說到底，方舟子跟聲稱要廢除中醫使用西醫一樣，讓西方獲得科學技術的話語權，只不過把范圍擴展到了事關中國病人生命健康的范圍，擴展到了中華民族的糧食安全和身體健康，乃至子孫后代的安全和健康上。一是把糧食經營的經濟權交給西方，讓西方來控制，另一方面，讓中國人做西方的小白老鼠，作為實驗品，更可以把安全系在西方人的手里，隨時可以在基因里轉點什么東西（因為他說過，想轉什么是可控制的），可見此人的陰險之心。把中國人的一切都交給西方了。
3.方舟子說地震不可預報。說句實話，中國有記載的準確地震預報有好幾次，不過都是在文革時期。因為體制問題，那時候用的是群防群治，獲得了不錯的效果。因為改革開放了之后，中國就跟進了西方，更注重建筑的加固，減少了對預報的投入。但是這種情況，對占有人口多數的農村，卻是一個巨大的威脅。畢竟國家不可能給農村都建一個非常堅固的房子。但是這個工作不管是官方，還是民間都在繼續。取得了不錯的效果。
而方舟子卻極力打擊中國地震預報的積極性。說是以西方主流（美國）不能預報，中國也肯定不能預報。還說這是科學根本解決不了的問題，超出了科學的范圍。我不明白，既然不能預報，為什么中國在70年代有好幾次都預報準確了（只有海城被外國所承認，其他預報的幾次是在云南和貴州）。方舟子信口胡說，說什么是瞎貓碰見死耗子。那為什么外國都碰不到呢？為什么幾次都碰對了呢？唐山地震的時候，是因為地震專家的爭議，正在爭議的時候，地震發生了。而附近的青龍縣，卻早一步發布信息，也算不幸中的幸運，挽救了多少人啊！
我認為，方舟子對地震方面的言論，不是因為他認為地震不科學，而是方舟子認為，中國地震的研究，不能超過西方，必須以西方為主導。西方不能預報的，中國怎么能預報呢？這樣，中國必須向西方購買技術，西方也必須完全掌控中國。中國在天災方面，必須是西方想讓你活你就能活，西方想讓你死你就死。其實也就是這么一個想法和做法。
縱觀方舟子前后的言論，個人覺得，這個人最初的打假，只是一個為自己頭上放光環的行動，在獲取國人的信任之后，就開始忽悠大家。其實他很明白眾多中國人的心理。中國人重感情，只要有了感情傾向，那么就比較容易信任誰，哪怕這個人說錯話，也就是現在播放的奴才劇中的奴才，皇帝死了，他還對皇帝忠心耿耿?？梢哉f，方舟子利用這些情感，已經獲得了不少人的信任。
但是，他卻沒想到，更多的中國人在毛主席的教育下，在之后的自我學習中，當然明白帝國主義及其走狗的狼子野心，當然知道他們是在做什么。
方舟子迷惑不了大眾，他只是一個帝國注意派來的并不成功的走狗而已?，F在除了歇斯底里，已經沒有多少人認同他了。
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