生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量，指的是生態(tài)系統(tǒng)的健康狀態(tài)，這種狀態(tài)表現(xiàn)為生態(tài)系統(tǒng)自我維持與抗干擾能力的大小。健康的生態(tài)系統(tǒng)具有良好的結(jié)構(gòu)即生產(chǎn)者、消費者與分解者，有較高的生產(chǎn)力，能夠發(fā)揮生態(tài)系統(tǒng)的多種功能，如生物多樣性維護、水土保持、食物供應(yīng)、氣候調(diào)節(jié)、水循環(huán)等。高質(zhì)量的生態(tài)系統(tǒng)中沒有廢物，元素循環(huán)與能量流動均能夠正常進(jìn)行。一般地，評價生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量需要一些人為選擇的指標(biāo)，這些指標(biāo)反映生態(tài)系統(tǒng)的內(nèi)涵及特征。對于所有生態(tài)系統(tǒng)類型，通用的生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量評估指標(biāo)一般包括：
①生物物種：即植物、動物、微生物的種類和數(shù)量，及空間分布格局等。物種是生態(tài)系統(tǒng)的核心成分，不同物種相互關(guān)聯(lián)，有競爭也有合作，共同維護生態(tài)系統(tǒng)運作，即能量流動與元素循環(huán)。
②大氣質(zhì)量：包括大氣背景值;降雨、降雪pH值、空氣污染物濃度等。大氣是生態(tài)系統(tǒng)的氣體成分，可為光合作用與固氮作用提供原料，同時提供水、熱等資源，大氣清潔度與正常流動是生態(tài)系統(tǒng)健康的重要標(biāo)志。全球氣候變暖就是由于大氣中的二氧化碳等溫室氣體濃度升高而引起的。
③土壤質(zhì)量：土壤承載著植被;很多底棲物種在土壤中生存;生態(tài)系統(tǒng)中的元素地球化學(xué)循環(huán)也重要發(fā)生在土壤圈內(nèi)。土壤類型，土壤元素背景值，土壤質(zhì)量(肥力、水分、質(zhì)地、厚度)等都是土壤質(zhì)量的重要指標(biāo)。
④水分質(zhì)量：生態(tài)系統(tǒng)中的水分包括淡水與海水(構(gòu)成海洋生態(tài)系統(tǒng)的主體)兩大類，一般陸地生態(tài)系統(tǒng)中的水以地表水狀況、地下水狀況為主，淡水中分布魚類、兩棲類，鳥獸類的飲用水也來自生態(tài)系統(tǒng)。人類不合理的經(jīng)濟活動首先引起陸地水污染，質(zhì)量嚴(yán)重下降，其次是造成海洋污染如赤潮、白色污染等。
⑤氣候要素：年降水量;降水分步均勻度;災(zāi)害性天氣日數(shù);無霜期;蒸發(fā)量;常年風(fēng)速等構(gòu)成生態(tài)系統(tǒng)的氣候因素，這些指標(biāo)均與生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量有關(guān)。
⑥環(huán)境質(zhì)量：環(huán)境指標(biāo)是針對人類利用生態(tài)系統(tǒng)資源而定義的，一般將綠色植被覆蓋率、人均綠地面積、資源和環(huán)境保護程度、土地資源土地總面積;森林面積;草原面積;農(nóng)田面積;可利用水域面積;可利用山地丘陵面積;可利用灘涂面積;可利用濕地面積;水資源總量、可利用水資源量等列為生態(tài)系統(tǒng)中的環(huán)境質(zhì)量指標(biāo)。
除了上述自然生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量，還有兩大類生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量出現(xiàn)了發(fā)展問題，必須引起高度重視。它們均以人工生態(tài)系統(tǒng)為主。
農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量：農(nóng)業(yè)與城市生態(tài)系統(tǒng)與人類活動密切相關(guān)。近一個世紀(jì)以來，農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)由于大量采用工業(yè)化辦法，出現(xiàn)了嚴(yán)重的耕地質(zhì)量下降;農(nóng)業(yè)生物多樣性下降或消失，突出表現(xiàn)在天敵和授粉昆蟲減少;人類培育了上萬年的作物或動物優(yōu)良遺傳基因喪失;大量農(nóng)藥、化肥、地膜使用造成耕地污染，直接導(dǎo)致人類食物鏈污染。當(dāng)今中國經(jīng)濟社會和諧發(fā)展，必須充分考慮到農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量。針對我國農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)退化問題，中央指示要嚴(yán)格保護耕地，擴大輪作休耕試點，健全耕地草原森林河流湖泊休養(yǎng)生息制度。采取生態(tài)農(nóng)業(yè)辦法修復(fù)退化的農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)，維持較高的生產(chǎn)力與健康安全的食物多樣性，是農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量研究的重要內(nèi)容。
城市生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量：城市生態(tài)系統(tǒng)也屬于人工生態(tài)系統(tǒng)，是在自然生態(tài)系統(tǒng)或農(nóng)田基礎(chǔ)上建立的人工生態(tài)系統(tǒng)。如果沒有人為因素，它的抵抗力穩(wěn)定性和恢復(fù)力穩(wěn)定性都比較脆弱。增加物種數(shù)量和營養(yǎng)結(jié)構(gòu)的復(fù)雜程度，可提高城市生態(tài)系統(tǒng)抵抗力與穩(wěn)定性。當(dāng)前，城市生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量提升的重點在于增加城市生物多樣性，減少硬化空間，發(fā)展海綿城市，加大城市代謝途徑研究。城市垃圾尤其可降解生活垃圾轉(zhuǎn)變有機肥，可為農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)提供大量的有機肥，從源頭減少礦山開采壓力。城市發(fā)展好了，可以提升自然生態(tài)系統(tǒng)恢復(fù)潛力，并促進(jìn)農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量提升。
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