關于轉基因的安全性問題，這個問題本身在國內外學界一直有激烈的爭論，公說公有理，婆說婆有理，目前誰也說服不了誰，誰也拿不出足夠的證據說它絕對安全或者絕對不安全。
但是，轉基因問題不僅僅是一個食用它是否安全的問題。即使忽略轉基因食物的生物有害性問題，若大量引進外來轉基因農作物，則將威脅中國全體國民賴以為生的長遠食物和種植業的國家安全。這并非危言聳聽!
因為轉基因作物有三個主要生物特點：
一是對原始的野生農作物具有逐滅作用，一旦大規模種植了轉基因作物，當地原始野生農作物將被驅逐絕滅，這一點已被國內外大量種植地的實踐證明，不再屬于理論問題;
二是大多數轉基因產品都是絕育產品，就象騾子，不能復制繁殖。無法像原來農作物那樣，可以用打下的糧食作為來年的種子，而只能每年都購買新種子。轉基因的作物，只能種植一次，收獲的果實不能再次進行培育種值，這和傳統的作物不同!傳統作物是可以收獲后，進行N次的培育種植。轉基因作物也能發芽，但不能進行培育，因為生長起來不開花，自然就不能授粉，也就不能長出果實。世界上主要農作物轉基因種子的專利權全部屬于孟山都、拜耳、杜邦三家跨國大公司，購買種子就要支付昂貴的專利費。壟斷了一國的種子也就壟斷控制了他國的糧食命脈。
[此即育種壟斷。轉基因作物如大米、玉米不能留種是常識。要是轉基因作物能留種，孟山都的轉基因物種豈不是有被大量盜版的危險?巨大銷售利潤如何能維持?]
三是轉基因作物對農藥化肥具有特殊要求，因此種植后只能使用轉基因種子公司指定的特種農藥化肥。
以后中國農民的種子，再也不能由農民自己掌握，因為轉基因大米、玉米等植物是不能留種的，中國農民的自主權，中國人食物安全的根本權利，由此全部掌握在利益集團和他們背后的跨國公司手中。
另外，轉基因糧食的其他配套費用，如特用的除草劑、化肥等等也全部掌握在跨國公司手里。
而大量引進種植國外轉基因物種將對國內自然原生態物種和環境造成嚴重污染，即使以后想恢復原來的原生態物種和環境也將不可能。
【附錄：美國的轉基因食品政策】
1、美國超市中非轉基因食品做有機“Organic"標志
美國銷售的食品雖然不標記“轉基因”，但是対非轉基因食品如豆奶、牛奶、豆腐、雞蛋包裝盒上印有“Organic" (有機產品)字樣;豆奶印著Organic soymilk;牛奶印著Organic milk;豆腐則印著美國農業部認證的有機食品字樣，或者非轉基因食品 (Non-Genetically Modified Organism, Non-GMO);不吃轉基因豆粕飼養的雞產的蛋，也是清楚地標注著Organic eggs(有機雞蛋)。
有機食品的價格大大高于非有機、轉基因食品。這樣就可以確保富人和精英可以避免食用轉基因食品。
2、美國科學院環境醫學研究院得出的結論引起了轟動
2009年5月，美國環境醫學科學研究院推出報告稱：“一些動物實驗表明，食用轉基因食品有嚴重損害健康的風險，包括不育，免疫問題，加速老化，胰島素的調節和主要臟腑及胃腸系統的改變”。
報告強烈建議：轉基因食品對病人有嚴重的安全威脅，號召成員醫生不要讓他們的病人食用轉基因食品，并教育所在社區民眾盡量避免食用轉基因食品。
對于轉基因的的侵害原理，研究院指出：插入到轉基因大豆里的基因會轉移到生活在我們腸道里的細菌的DNA里面去，并繼續發揮作用。這意味著吃了之后，我們雖然不吃轉基因食物，在我們體內仍然不斷產生有潛在危害的基因蛋白質，“說透徹一點，吃轉基因玉米，會把我們的腸道細菌轉變成生活著的農藥制造廠，可能直至我們死為止”。
報告發布后，美國衛生部2009年底也發表科學論文，指明轉基因食品可對內臟造成傷害。據美國國家科學基金會的調研報告顯示，多數民眾對轉基因持有負面態度和懷疑態度。
其實，早在2008年，美國科學家便證實了長時間喂食轉基因玉米的小白鼠免疫系統會受到損害，該研究成果發表在同年《農業與食品化學》雜志上。
3、美國 FDA撤銷一項批準
2009年4月，美國政府主管食品藥品的FDA宣布撤消它在數年前頒布的CRY 9C轉基因玉米種植的工業指南
主要原因之一，就是該轉基因作物對人類健康安全有嚴重威脅。
4、美國國防認為轉基因是威脅未來的生物技術
2012年11月，美國國防工業領域的領銜行業機構的《國防》雜志發表專題文章《今后十年的五個頂級威脅》，把以轉基因技術為主要內容的生物武器襲擊作為第一個威脅、排在核武器襲擊威脅之前。那五個頂級威脅是：頭號威脅是生物武器攻擊，之后是核武器攻擊、信息武器攻擊、氣象武器攻擊、跨國行為攻擊。該雜志把亞洲列為今后十年五大威脅發作的作戰地或發祥地。
5、美國不提供轉基因研究的官方資金支持
從官方財政支持來說：美國官方幾乎就沒有給轉基因種子開發提供什么資金，而是把國家資金用于應對生物戰爭的生物國防和國防資源的建設方面、其中包括天然有
機農業和天然種子建設。
從官方財政支持來說：美國官方幾乎就沒有給轉基因種子開發提供什么資金，而是把國家資金用于應對生物戰爭的生物國防和國防資源的建設方面、其中包括天然有機農業和天然種子建設。
而中國呢，官方為轉基因種子開發提供的國家資金，公開的就有210億元，而對天然有機農業的國家資助則是微乎其微、甚至連不要國家資金而自助開發的有關項目申請、也予以槍斃。
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